Bitki Koruma bölümü, tarımsal üretimde bitki hastalıkları, zararlıları ve yabancı otlarla mücadele konusunda uzman yetiştiren bir programdır. Entomoloji, fitoatoloji, herbioloji ve biyolojik mücadele yöntemleri konularında kapsamlı eğitim verilir. Öğrenciler modern laboratuvar teknikleri ve saha uygulamaları ile deneyim kazanırlar. Mezunlar tarım işletmelerinde, zirai ilaç firmalarında ve Tarım Bakanlığı birimlerinde bitki koruma uzmanı olarak çalışabilirler.